L'AFREC a été créée par la décision AHG/Dec.167 (XXXVII) du 37ème Sommet des Chefs d'Etats et de Gouvernements africains de l'ancienne Organisation de l'Unité Africaine (OUA), aujourd’hui l’Union africaine (UA), tenu à Lusaka, Zambie, le 11 juillet 2001. Elle a été officiellement lancée par les Ministres de l'Union Africaine en charge de l'énergie lors de la réunion tenue du 15 au 17 février 2008 à Alger, Algérie, par la Déclaration d'Alger AU/EXP/EN/Decl. (III)

Lors de son treizième Conseil ordinaire tenu du 24 au 28 juin à Sharm El Sheikh, Égypte, le Conseil exécutif de l'Union africaine a approuvé la Déclaration d'Alger sur le lancement officiel de l'AFREC (décision EX.CL/Dec.432 (XIII)). À ce jour, quarante-six États membres ont signé la Convention, dont trente-cinq (35) l'ont ratifiée et déposée, tandis que la ratification des autres États membres est toujours en cours.